Salut,
Sous Windows, on utilise les fonctions de dessin de la GDI: SetPixel(), Ellipse(), Rectangle(), MoveToEx(), LineTo() etc. Pour utiliser la souris, il faudra traiter le message WM_LBUTTONDOWN, dessiner en suivant le mouvement du curseur (WM_MOUSEMOVE) et finir l'opération une fois WM_LBUTTONUP détecté. La fonction SetCapture() sera utile pour capturer puis relacher la souris.
Voici le lien MSDN:
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/dd145203%28v=VS.85%29.aspx